por Edson Luiz Folador
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última modificação
24/02/2021 15h20
Com o avanço e utilização das técnicas de alto rendimento uma enorme quantidade
de interações proteína-proteína estão disponíveis em diversos bancos de dados.
Interações proteína-proteína são importantes pois permitem determinar se uma
proteína é essencial para a manutenção da vida de um organismo. Identificar dentre
as proteínas de um organismo quais lhe são essenciais é importante para diversas
aplicações, como o desenvolvimento de fármacos. Procuramos neste trabalho, pelo
método de interolog mapping, predizer a rede de interação proteína-proteína visando
identificar e validar a essencialidade das proteínas hub de Corynebacterium ulcerans,
sugerindo assim o seu uso como novos alvos para candidatos a drogas. O
microrganismo em questão é uma das bactérias causadoras da difteria com maior
potencial mutagênico, por ter como hospedeiros não só humano como também
animais e por conta da difteria se manter endêmica em países como Índia e
Venezuela. Identificamos 457 proteínas hub na rede de C. ulcerans e destas 421
(92,12%) tiveram essencialidade comprovada e 36 (7,88%) consideradas essenciais
após análises funcionais e de enriquecimento. Com o potencial de serem utilizadas
como alvo para drogas, tivemos 351 (76,8%) proteínas hub sem homologia com H.
sapiens. Dentre estas 99 (21,66%) tiveram estrutura tridimensional predita, validada e
com pockets drogáveis, viáveis para docking. No estudo de caso com as proteínas
alvo dentre 42 derivados sintéticos de alcalóides tetrahidroisoquinolínicos foram
identificados os seis mais promissores para serem usados como droga.
Palavras chaves: Corynebacterium ulcerans; interolog mapping; rede de interação
proteína-proteína; proteínas essenciais; docking molecular; alcalóides
tetrahidroisoquinolínicos; candidatos a droga;
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2019.4