ANÁLISE GENÔMICA E METABOLÔMICA DE UMA LINHAGEM DE STREPTOMYCES GALBUS ISOLADA DO SEMIÁRIDO PARAIBANO
por Edson Luiz Folador
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última modificação
25/02/2021 16h35
A resistência antimicrobiana vem alertando entidades governamentais e a
Organização Mundial da Saúde (OMS) com uma iminente crise global provocada
pelo aumento gradativo da ineficácia de antibióticos frente a patógenos
multirresistentes. As actinobactérias têm sido a maior fonte dos antibióticos utilizados
clinicamente. Membros desse filo estão presentes em vários ambientes, inclusive,
ambientes considerados extremos (como o bioma Caatinga), os quais têm sido o
foco de exploração de novos antibióticos. Com isso, modernas abordagens
começam a ser adotadas, em adição da exploração desses ambientes inexplorados.
Entre eles, o sequenciamento genético juntamente com a aplicação de ferramentas
da bioinformática na mineração de genomas tem ajudado a conhecer a diversidade
de bactérias e os metabólitos secundários que estas produzem. Como também,
métodos analíticos como cromatografia associada a espectrometria de massas para
análises de extratos têm surgido como formas de mudar o panorama frente à
pesquisa de novas moléculas com potencial antibiótico. Nesse estudo, uma
linhagem de actinomiceto isolado na região do Cariri paraíbano que apresenta uma
excelente atividade antimicrobiana e antitumoral, teve seu genoma sequenciado,
anotado e estimado in silico quanto à produção de metabólitos secundários de
interesse. A partir de análises genômicas, o isolado apresenta tamanho do genoma
de 7 548 406 pares de bases e um alto conteúdo de guanina e citosina de 73,16%.
Com análises filogenéticas, a linhagem I339 foi classificada como pertencente à
espécie Streptomyces galbus e mostrou uma relação íntima com a S. galbus DSM
40089 e um distanciamento com a S. longwoodensis DSM 41677, a qual pôde ser
visualizada através de análises de genômica comparativa entre as espécies. A
análise de agrupamentos de genes relacionados a síntese de metabólitos mostrou a
presença de 47 agrupamentos para S. galbus I339, sendo alguns destes,
relacionados à produção de moléculas com atividade antimicrobiana e antitumoral.
Através de análises de cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas
(GC-MS) e por ionização em eletrospray seguido de espectrometria de massas (ESIToF-MS) foram identificados compostos com potencial antimicrobiano e
anticancerígeno como as dicetopiperazinas e o grupo das actinomicinas. Além do
mais, foram identificadas diversas massas que não puderam ser associados a
compostos já descritos, os quais podem estar relacionadas a novas moléculas. As
predições in silico associadas aos métodos de análise físico-química demonstram
uma notável capacidade da linhagem I339 de S. galbus para a produção de
metabólitos secundários, sendo uma grande candidata a produção de novas
moléculas com propriedades antibióticas.
Palavras-chave: Resistência antimicrobiana. Actinobactéria. Metabólitos
secundários. Desreplicação. Mineração de genomas.
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